Lungo il tratto finale del Viale delle Cappelle, patrimonio UNESCO dal 2003, si trova la Casa Museo Pogliaghi, residenza dell’artista milanese autore della porta del Duomo di Milano. Lavorando al restauro delle Cappelle seicentesche, Pogliaghi rimase talmente colpito dalla bellezza e tranquillità del Sacro Monte di Varese che decise di costruire qui la sua residenza, concependola come laboratorio-museo.
Grande appassionato d'arte e artista a tutto tondo, Pogliaghi ha creato una villa eclettica, all'interno della quale è possibile ammirare una collezione d'arte internazionale che spazia dai sarcofagi egizi e dai reperti greco-romani a porcellane e stampe orientali esposti accanto alle opere dello stesso artista, tra le quali spicca il modello originale in gesso a grandezza naturale della porta del Duomo di Milano. In totale, la casa museo ospita più di 1500 opere tra dipinti, sculture e arti applicate e circa 580 oggetti archeologici.
Proprietà della Veneranda Biblioteca Ambrosiana di Milano, la Casa Museo Pogliaghi è stata riaperta al pubblico nel 2014.