Vrijwel het gehele ruige en moeilijk bereikbare westelijke deel van het eiland valt onder de bescherming van het Natura 2000-netwerk van de EU.
De beste manier om dit gebied te ontdekken is door deel te nemen aan een leerzame hele dag-tour in een 4x4-terreinwagen, onder leiding van een deskundige lokale gids. Je krijgt de kans om een slapende vulkaan te bezoeken en meer te weten te komen over de structuur ervan, trekvogels te spotten in de moerasgebieden van Achivadolimni en te wandelen door opvallende roestrode grotten in een verlaten mangaanmijn bij Kaap Vani. Na deze avonturen kun je even bijkomen op het afgelegen, zandstrand van Agathia.
Een speciaal samengestelde excursie vindt plaats in het hart van het natuurreservaat in het westen van Milos. Dit gebied, beschermd door het Natura 2000-milieuprogramma, is een uniek en ongerept Cycladisch ecosysteem vol spectaculaire landschappen met een rijke diversiteit aan dieren en planten. De excursie biedt een reis door de tijd, waarbij schilderachtige vulkanische locaties, vergeten kapelletjes, verlaten 19e-eeuwse mijnen, verkwikkende thermale warmwaterbronnen en zwemmen op afgelegen stranden met een uitgestrekte kustlijn en kristalhelder water worden onthuld. De tour omvat ook een lunchpauze in een visueel aantrekkelijke omgeving aan het water.