Die Krypta der Wallfahrtskirche ist das Herzstück der Geschichte von Santa Maria del Monte und kann ausnahmsweise auch während der Weihnachtszeit besichtigt werden. Im Inneren befinden sich die Überreste der ersten auf dem Berg erbauten Kirche und Fresken aus dem 14.-15. Jahrhundert, die die Wände schmücken, sowie wichtige archäologische Zeugnisse, die von der Antike des Kults und des Ortes zeugen. Der Besuch wird es auch ermöglichen, die Restaurierungsarbeiten und die technischen Lösungen für die Wiedereröffnung im Jahr 2015 kennenzulernen und die älteste "Krippe" von Santa Maria del Monte zu bewundern.
Das Ticket beinhaltet auch den Eintritt in das Baroffio-Museum, in dem authentische Meisterwerke der lombardischen Kunst vom Mittelalter bis zum 18. Jahrhundert, flämische und niederländische Gemälde von Baroffio und Werke einiger Protagonisten der europäischen Kunst des 20 Matisse und Georges Rouault.
Dank des von Monsignore Pasquale Macchi gewünschten Raums mit marianischem Thema mit mehr als sechzig Werken bekannter Künstler des 20 Manfrini und Trento Longaretti angeboten. Die private Terrasse des Museums bietet einen weiten Blick auf das Panorama.