De crypte van het heiligdom is het hart van de geschiedenis van Santa Maria del Monte en het zal uitzonderlijk mogelijk zijn om het ook tijdens de kerstperiode te bezoeken. Binnen zijn er de overblijfselen van de eerste kerk gebouwd op de berg en veertiende-vijftiende-eeuwse fresco's die de muren verfraaien, evenals belangrijk archeologisch bewijs dat getuigen van de oudheid van de cultus en de plaats. Het bezoek maakt het ook mogelijk om kennis te maken met de restauratiewerken en de technische oplossingen die zijn aangenomen voor de heropening voor het publiek in 2015, evenals om de oudste "geboorte" van Santa Maria del Monte te bewonderen.
Het ticket omvat ook toegang tot het Baroffio Museum, waar authentieke meesterwerken van Lombardische kunst worden bewaard, van de middeleeuwen tot de 18e eeuw, Vlaamse en Nederlandse schilderijen geschonken door Baroffio, en werken van enkele protagonisten van de 20e-eeuwse Europese kunst, zoals Henri Matisse en Georges Rouault.
Dankzij de door monseigneur Pasquale Macchi gewenste ruimte met een Maria-thema met meer dan zestig werken van bekende kunstenaars uit de 20e eeuw, een bijzondere kijk op auteurs die ook bij Sacro Monte hebben gewerkt zoals Renato Guttuso, Floriano Bodini, Enrico Manfrini en Trento Longaretti worden aangeboden. Het privéterras van het museum biedt een weids uitzicht over het panorama.